nnsvg
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doi：10.18129/b9.bioc.nnsvg
这是发展nnsvg的版本;对于稳定版本，请参阅nnsvg。
在空间分辨的转录组数据中对空间可变基因的可扩展鉴定
生物导体版本：开发（3.16）
在空间分辨的转录组学数据中可扩展鉴定空间可变基因（SVG）的方法。该方法基于最近的邻居高斯工艺，并使用Brisc算法进行模型拟合和参数估计。允许识别和排名在组织滑块或协变量定义的空间域内具有柔性长度尺度的SVG。与空间位置的数量线性尺度，可以应用于包含数千个或更多空间位置的数据集。
作者：Lukas M. Weber [AUT，CRE]
，斯蒂芬妮·希克斯[aut]
维护人员：lukas M. Weber
引用（从r内，输入引用（“ nnsvg”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ nnsvg”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ nnsvg”）
| html | R脚本 | NNSVG教程 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 基因表达，，，，预处理，，，，Singlecell，，，，软件，，，，空间，，，，转录组学 |
| 版本 | 1.1.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.15（R-4.2）（<6个月） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 4.2） |
| 进口 | Spatiaxlexperiment，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，棕色，，，，生物比较，，，，矩阵，，，，矩阵，统计，方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Stexampledata，，，，斯克兰，，，，GGPLOT2，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/lmweber/nnsvg |
| BugReports | https://github.com/lmweber/nnsvg/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | nnsvg_1.1.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | nnsvg_1.1.2.2.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | nnsvg_1.1.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nnsvg |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/nnsvg |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/nnsvg/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
