nethet

DOI:10.18129 / B9.bioc.nethet

这是发展nethet版本;稳定的发布版本,请参阅nethet。

bioconductor包高维探索生物网络的异质性

Bioconductor版本:发展(3.17)

包nethet是统计的实现固体的方法使网络异质性从高维数据分析。它结合了几个最近统计的实现创新的用于评估和比较在异构网络,高维设置。特别是,我们提供正式的两个示例测试代码高斯图形模型(微分网络和GGM-GSA;施穆克吉,2013,2014)和提供一种新颖的基于网络的聚类算法(混合图形套索,施穆克吉,2013)。

作者:尼古拉•Staedler弗兰克Dondelinger

维护人员:尼古拉斯Staedler < Staedler。在gmail.com n >,弗兰克Dondelinger < fdondelinger。在gmail.com工作>

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“nethet”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“nethet”)

PDF	R脚本	nethet
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,GraphAndNetwork,软件
版本	1.31.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(8年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	glasso,mvtnorm,GeneNet,巨大的,CompQuadForm,药物,mclust平行,GSA,limma,乘,ICSNP,glmnet,网络,ggplot2、grDevices图形、属性、跑龙套
链接
建议	knitr,xtable,BiocStyle,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	nethet_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	nethet_1.31.0.zip
macOS二进制(x86_64)	nethet_1.31.0.tgz
macOS二进制(arm64)	nethet_1.31.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nethet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ nethet
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/nethet/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/nethet/
包下载报告	下载数据