- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- nempi(开发版)
nempi
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DOI:10.18129 / B9.bioc.nempi
这是发展nempi版本;稳定的发布版本,请参阅nempi。
从基因表达数据推断未被注意的扰动
Bioconductor版本:发展(3.18)
使用一个不完整的微扰概要文件作为输入,并在日志赔率和推断基因差异表达的扰动和增加观察的。推理是由迭代地推断一个网络的扰动和推断网络的扰动。网络推理是由嵌套的影响模型。
作者:马丁Pirkl (aut (cre)
维护人员:马丁Pirkl < martinpirkl在yahoo.de >
从内部引用(R,回车引用(“nempi”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“nempi”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ATACSeq,CRISPR,分类,DNASeq,DifferentialExpression,DifferentialMethylation,GeneExpression,GeneSignaling,网络,NetworkInference,NeuralNetwork,通路,PooledScreens,RNASeq,SingleCell,软件,SystemsBiology |
| 版本 | 1.9.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.1),mnem |
| 进口 | e1071、nnet randomForest, naturalsort、图形数据,跑龙套,matrixStats,epiNEM |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,BiocGenericsrmarkdown RUnit,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/cbg-ethz/nempi/ |
| BugReports | https://github.com/cbg-ethz/nempi/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | nempi_1.9.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nempi |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ nempi |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/nempi/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/nempi/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
