- 家
- Bioconductor 3.18
- 软件包
- ncRNAtools(开发版)
ncRNAtools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ncRNAtools
这是发展ncRNAtools版本;稳定的发布版本,请参阅ncRNAtools。
非编码RNA的R工具包
Bioconductor版本:发展(3.18)
ncRNAtools提供了一组基本的工具来处理和分析非编码rna。这些包括工具访问RNAcentral数据库和预测和可视化的非编码rna二级结构。包还提供了工具来读、写和互换等代表的文件格式最常用的二级结构。
作者:劳拉出售维达尔(cre, aut)
拉斐尔•阿亚拉(aut),Guy-Bart斯坦(aut),罗德里戈Ledesma-Amaro (aut)
维修工:劳拉出售比达尔<劳拉。销售在oist.jp >
从内部引用(R,回车引用(“ncRNAtools”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ncRNAtools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ncRNAtools”)
| HTML | R脚本 | rfaRm |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport,FunctionalGenomics,软件,StructuralPrediction,ThirdPartyClient,可视化 |
| 版本 | 1.11.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | |
| 进口 | httr xml2,跑龙套,方法、grDevices ggplot2,IRanges,GenomicRanges,S4Vectors |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,BiocStylermarkdown RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/LaraSellesVidal/ncRNAtools/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ncRNAtools_1.11.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ncRNAtools_1.11.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | ncRNAtools_1.11.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ncRNAtools |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ncRNAtools |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ncRNAtools/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ncRNAtools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
