ncGTW

DOI:10.18129 / B9.bioc.ncGTW

这是发展ncGTW版本;稳定的发布版本请参见ncGTW。

LC-MS配置文件的对齐通过邻域合成特定的图形时间扭曲与错位检测

生物导体版本:开发(3.13)

ncGTW的目的是帮助XCMS进行LC-MS数据对齐。目前，ncGTW可以通过XCMS检测出未对齐的特性组，用户可以选择是否通过ncGTW重新对齐这些特性组。

作者:吴忠庭

维护者:吴忠廷

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ncGTW")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ncGTW”)

超文本标记语言	R脚本	ncGTW用户手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本	1.5.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	方法,BiocParallel,xcms
进口	Rcpp， grDevices，图像，统计
链接	Rcpp
建议	BiocStyle,knitr,testthat,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/ChiungTingWu/ncGTW/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ncGTW_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	ncGTW_1.5.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ncGTW_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ncGTW
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ncGTW
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ncGTW/
包下载报告	下载数据