多lust
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doi：10.18129/b9.bioc.multiclust
这是发展Multic -Lust的版本；对于稳定版本，请参阅多lust。
多lust：用于识别癌症转录组轮廓中生物学相关簇的R包装
生物导体版本：开发（3.16）
进行聚类以识别转录组学特征的模式，以确定患者的临床相关亚组。特征（基因）选择是过程的关键和组成部分。当前，有许多特征选择和聚类方法来识别相关基因并执行样品的聚类。但是，选择适当的方法很难。此外，可用软件包尚未支持广泛的特征选择方法。因此，我们开发了一种称为Multiclust的综合R包装，使研究人员可以轻松地尝试选择基因选择和聚类的方法的组合。使用Multic -Lust，我们在临床结局的背景下确定了最佳性能聚类方法。我们的观察结果表明，只要选择了适当的基因数量，诸如基于方差的排名之类的简单方法（基于方差的排名）在大多数数据集上表现良好。但是，由于没有方法对所有研究都起作用，因此不同的基因排名和选择方法仍然相关。
作者：Nathan Lawlor [AUT，CRE]，Peiyong Guan [aut]，Alec Fabbri [aut]，Krish Karuturi [aut]，Joshy George [aut]
维护者：gmail.com上的Nathan Lawlor
引用（从r内，输入引用（“多lust”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ multiclust”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“多lust”）
| html | R脚本 | 多层性指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 聚类，，，，特征提取，，，，基因表达，，，，软件，，，，生存 |
| 版本 | 1.27.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（6年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | |
| 进口 | mclust，，，，CTC，，，，生存，，，，簇，，，，Dendextend，，，，一张地图，图形，grdevices |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，GPLOTS，，，，运行，，，，生物基因，，，，预处理，，，，生物酶，，，，地球 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | MULTICLUST_1.27.0.TAR.GZ |
| Windows二进制 | MULTICLUST_1.27.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | MulticLust_1.27.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiclust |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/multiclust |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/multiclust/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
