MSQROB2
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doi：10.18129/b9.bioc.msqrob2
这是发展MSQROB2的版本;对于稳定版本，请参阅MSQROB2。
定量LC-MS蛋白质组学的强大统计推断
生物导体版本：开发（3.16）
MSQROB2提供了一个可靠的线性混合模型框架，用于评估基于MS的定量蛋白质组学实验中的差异丰度。我们的工作流可以从原始肽强度或汇总的蛋白质表达值开始。模型参数估计值可以通过脊回归，经验贝叶斯方差估计和强大的M估计来稳定。MSQROB2的Hurde工作流可以处理丢失的数据，而不必依赖难以验证的插补假设，并且，以有或没有归为高缺失和低缺失性的最先进的方法。它建立在定量质谱数据的QFeature基础架构上，以将模型结果与原始数据和预处理数据一起存储。
作者：Lieven Clement [AUT，CRE]
，Laurent Gatto [AUT]，Oliver M. Crook [Aut]，Adriaan Sticker [CTB]，Ludger Goeminne [CTB]，Milan Malfait [CTB]，Stijn Vandenbulcke [aut]
维护者：lieven clement
引用（从r内，输入引用（“ MSQROB2”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ msqrob2”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ msqrob2”）
| html | R脚本 | A.两个小组设计的无标签工作流程 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，实验设计，，，，免疫学，，，，质谱，，，，多重组合，，，，正常化，，，，预处理，，，，蛋白质组学，，，，回归，，，，软件，，，，时间科 |
| 版本 | 1.5.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.13（R-4.1）（1年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 4.1），qfeatures（> = 1.1.2） |
| 进口 | 统计，方法，LME4，，，，purrr，，，，生物比较，，，，矩阵，，，，大量的，，，，林玛，，，，总结性特征，，，，CodeTools |
| 链接 | |
| 建议 | 多comp，，，，栅格，，，，尼特，，，，生物使用，，，，Refmanager，，，，SessionInfo，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，平淡无奇，，，，情节，，，，MSDATA，，，，MSNBase，，，，矩阵，，，，mscoreutils |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/statomics/msqrob2 |
| BugReports | https://github.com/statomics/msqrob2/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | MSQROB2_1.5.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MSQROB2_1.5.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | MSQROB2_1.5.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msqrob2 |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/msqrob2 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/msqrob2/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
