M型

doi：10.18129/b9.bioc.mspurity

这是发展MSPURITY的版本；对于稳定版本，请参阅M型。

对代谢组学中基于质谱的片段化的前体离子纯度的自动评估

生物导体版本：开发（3.16）

通过评估“前体离子纯度”来评估片段化光谱的光谱质量：1）评估片段化光谱的光谱质量。2）工艺碎裂光谱。3）执行光谱匹配。什么是前体离子纯度？- 我们所说的“前体离子纯度”是对用于碎片的隔离窗口中选定的前体峰的贡献的度量。简单的计算涉及将所选前体峰的强度除以隔离窗口的总强度。在评估MS/MS光谱时，该计算是在感兴趣的MS/MS扫描之前和之后完成的，并在MS/MS采集的记录时间内插值。此外，可以去除同位素峰，去除低丰度峰，被认为对所得的MS/MS光谱的贡献有限，并且可以使用质谱仪的隔离效率来使用于计算的强度正常化。

作者：Thomas N. Lawson [AUT，CRE]，Ralf Weber [CTB]，Martin Jones [CTB]，Julien Saint-Vanne [CTB]，Andris Jankevics [CTB]，Mark Viant [THS]，Warwick Dunn [THS]

维护者：thomas N. Lawson

安装

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if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ mspurity”）

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文档

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html	R脚本	M型
html	R脚本	M型光谱数据库模式
html	R脚本	M型光谱匹配
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细节

生物浏览	质谱，，，，代谢组学，，，，软件
版本	1.23.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（6年）
执照	GPL-3 +文件执照
要看	RCPP
进口	plyr，，，，dplyr，，，，dbplyr，，，，马格里特，，，，foreach， 平行，Dosnow，，，，Stringr，，，，MZR，，，，RESHAPE2，，，，快速积分，，，，GGPLOT2，，，，DBI，，，，rsqlite
链接
建议	MSNBase，，，，测试，，，，XCMS，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，mspuritydata，，，，相机，，，，rpostgres，，，，rmysql
系统要求
增强
URL	https://github.com/computational-metabolomics/mspurity/
BugReports	https://github.com/computational-metabolomics/mspurity/issues/new
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源包	mspurity_1.23.0.tar.gz
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MacOS 10.13（高山脉）	mspurity_1.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mspurity
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/mspurity
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/mspurity/
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