M型

doi:10.18129/b9.bioc.mspurity

这是发展MSPURITY的版本;对于稳定版本,请参阅M型

对代谢组学中基于质谱的片段化的前体离子纯度的自动评估

生物导体版本:开发(3.16)

通过评估“前体离子纯度”来评估片段化光谱的光谱质量:1)评估片段化光谱的光谱质量。2)工艺碎裂光谱。3)执行光谱匹配。什么是前体离子纯度?- 我们所说的“前体离子纯度”是对用于碎片的隔离窗口中选定的前体峰的贡献的度量。简单的计算涉及将所选前体峰的强度除以隔离窗口的总强度。在评估MS/MS光谱时,该计算是在感兴趣的MS/MS扫描之前和之后完成的,并在MS/MS采集的记录时间内插值。此外,可以去除同位素峰,去除低丰度峰,被认为对所得的MS/MS光谱的贡献有限,并且可以使用质谱仪的隔离效率来使用于计算的强度正常化。

作者:Thomas N. Lawson [AUT,CRE],Ralf Weber [CTB],Martin Jones [CTB],Julien Saint-Vanne [CTB],Andris Jankevics [CTB],Mark Viant [THS],Warwick Dunn [THS]

维护者:thomas N. Lawson

引用(从r内,输入引用(“ M型”)):

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if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ mspurity”)

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生物浏览 质谱,,,,代谢组学,,,,软件
版本 1.23.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(6年)
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