这是发展mpra的版本;稳定版请参见mpra.
Bioconductor版本:开发(3.17)
用于大规模并行报告分析(MPRA)中的数据管理、计数预处理和差异分析的工具。
作者:Leslie Myint [cre, aut], Kasper D. Hansen [aut]
维护者:Leslie Myint < Leslie。Myint在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“mpra”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("mpra")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“mpra”)
超文本标记语言 | R脚本 | mpra用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | FunctionalGenomics,GeneRegulation,测序,软件 |
版本 | 1.21.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.5.0),方法,BiocGenerics,SummarizedExperiment,limma |
进口 | S4Vectors,尺度,统计,图形,statmod |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/hansenlab/mpra |
BugReports | https://github.com/hansenlab/mpra/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | mpra_1.21.0.tar.gz |
Windows二进制 | mpra_1.21.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | mpra_1.21.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | mpra_1.21.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mpra |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mpra |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/mpra/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/mpra/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |