moanin

DOI:10.18129 / B9.bioc.moanin

这是发展呻吟的版本;稳定版请参见moanin．

时间课程RNASeq数据分析的R包

Bioconductor版本:开发(3.17)

时间过程基因表达数据的简单高效的工作流程，建立在CRAN和bioconductor上托管的公开可用的开源项目上。Moanin提供了使用函数式数据分析分析时间过程数据所需的所有步骤的辅助函数:(1)时间过程数据的函数式建模;(2)差异表达分析;(3)聚类;(4)下游分析。

作者:伊丽莎白·珀多姆，内尔·瓦罗克[aut, cre]

维护者:Nelle Varoquaux < Nelle。Varoquaux在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("moanin")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“moanin”)

超文本标记语言	R脚本	呻吟包
PDF		参考手册
文本		自述
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，微阵列，RNASeq，软件，TimeCourse
版本	1.7.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	BSD 3-clause许可+文件许可证
取决于	R (>= 4.0)，SummarizedExperiment，topGO,统计数据
进口	S4Vectors，质量(> = 1.0.0),limma，冬青，刨边机，图形，方法，grDevices，reshape2，敝中断，动物园，ClusterR样条函数,matrixStats
链接
建议	testthat(> = 1.0.0),timecoursedata，knitr，rmarkdown，减价，covr，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	moanin_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	moanin_1.7.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	moanin_1.7.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	moanin_1.7.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/moanin
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/moanin
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/moanin/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/moanin/
软件包下载报告	下载数据