mirTarRnaSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.mirTarRnaSeq

这是发展mirTarRnaSeq版本;稳定版请参见mirTarRnaSeq。

mirTarRnaSeq

Bioconductor版本:开发(3.17)

mirTarRnaSeq R包可用于交互式mRNA miRNA测序统计分析。该软件包利用表达或差异表达mRNA和miRNA测序结果，并在mRNA和miRNA实验之间进行相互关联和各种GLMs(常规GLM，多元GLM和交互GLMs)分析。这些实验可以是时间点实验，或者条件实验。

作者:mercedes deh Movassagh [aut, cre]，莎拉·莫顿[aut]，拉斐尔·伊瑞扎里[aut]，杰弗里·贝利[aut]，约瑟夫·N·保尔森[aut]

维护者:mercedes - deh Movassagh < mercedes - deh at ds.dfci.harvard.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("mirTarRnaSeq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“mirTarRnaSeq”)

PDF	R脚本	mirTarRnaSeq
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，回归，测序，SmallRNA，软件，TimeCourse，microrna的
版本	1.7.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(2年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.1.0)，ggplot2
进口	purrr，质量，pscl，为了，caTools，dplyr，pheatmap，reshape2，corrplot， grDevices，图形，统计，utils，data.table，R.utils
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，R.cache，海绵
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	mirTarRnaSeq_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	mirTarRnaSeq_1.7.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	mirTarRnaSeq_1.7.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	mirTarRnaSeq_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mirTarRnaSeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mirTarRnaSeq
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/mirTarRnaSeq/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mirTarRnaSeq/
软件包下载报告	下载数据