microbiomeDASim

DOI:10.18129 / B9.bioc.microbiomeDASim

这是发展microbiomeDASim版本;稳定版请参见microbiomeDASim．

微生物组差异丰度模拟

Bioconductor版本:开发(3.17)

为纵向分析而设计的模拟差异微生物组数据的工具包。可以为平均趋势指定几种函数形式。观测结果来自多元正态模型。该软件包的目标是能够模拟数据，以便准确地比较不同的纵向差分丰度方法。

作者:贾斯汀·威廉姆斯，赫克托·科拉达·布拉沃，詹妮弗·汤姆，约瑟夫·纳撒尼尔·保尔森

维护者:Justin Williams < williamazo at ucla.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("microbiomeDASim")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“microbiomeDASim”)

PDF	R脚本	microbiomeDASim
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	微生物组，软件，可视化
版本	1.13.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(3.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	图形,ggplot2，质量，tmvtnorm，矩阵，mvtnorm，pbapply统计数据,phyloseq，metagenomeSeq，Biobase
链接
建议	testthat(> =魅惑,knitr，devtools
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/williazo/microbiomeDASim
BugReports	https://github.com/williazo/microbiomeDASim/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	microbiomeDASim_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	microbiomeDASim_1.13.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	microbiomeDASim_1.13.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiomeDASim
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/microbiomeDASim
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/microbiomeDASim/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/microbiomeDASim/
软件包下载报告	下载数据