miRmine

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRmine

这是发展miRmine版本;稳定的发布版本,请参阅miRmine。

数据包miRmine数据库作为RangedSummarizedExperiment miRNA-seq数据集

Bioconductor版本:发展(3.18)

miRmine数据库是一个集不同公开的表达谱miRNA-seq数据集,Panwar et al (2017) miRmine:人类microrna的表达的一个数据库,准备用这个作为RangedSummarizedExperiment数据包。

作者:科维奇Randjelovic (aut (cre)

维护人员:科维奇Randjelovic <科维奇。在sbgenomics.com randjelovic >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“miRmine”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ExpressionData,Homo_sapiens_Data,RNASeqData,SequencingData,软件
版本	1.23.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 3.5.0),SummarizedExperiment
进口
链接
建议	BiocStyleknitr rmarkdown,DESeq2
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制	miRmine_1.23.0.zip
macOS二进制(x86_64)	miRmine_1.23.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRmine
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRmine
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/miRmine/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miRmine/
包下载报告	下载数据