miRSM

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRSM

这是发展miRSM版本;稳定版请参见miRSM．

在异构数据中推断miRNA海绵模块

Bioconductor版本:开发(3.17)

该包旨在识别异构数据中的miRNA海绵模块。它提供了研究miRNA海绵模块的几个功能，包括流行的推断基因模块(候选miRNA海绵模块)的方法，以及识别miRNA海绵模块的功能，以及对miRNA海绵模块进行模块化分析的几个功能。

作者:张俊鹏[aut, cre]

维护人员:Junpeng Zhang

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("miRSM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“miRSM”)

超文本标记语言	R脚本	miRSM:在异构数据中推断miRNA海绵模块
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细节

biocViews	BiomedicalInformatics，聚类，GeneExpression，GeneRegulation，GeneSetEnrichment，GeneTarget，微阵列，软件
版本	1.17.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	WGCNA，flashClust，dynamicTreeCut，联合会，igraph，linkcomm，制程，NMF，biclust，iBBiG，fabia。，BicARE，isa2，s4vd，BiBitR，rqubic，Biobase，PMA统计数据,dbscan，子空间，mclust，宽边帽，ppclust，miRspongeR，Rcpp跑龙套,SummarizedExperiment，GSEABase，org.Hs.eg.db，MatrixCorrelation，能源
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/zhangjunpeng411/miRSM
BugReports	https://github.com/zhangjunpeng411/miRSM/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	miRSM_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	miRSM_1.17.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	miRSM_1.17.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	miRSM_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRSM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRSM
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/miRSM/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miRSM/
软件包下载报告	下载数据