miRNAtap

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRNAtap

这是发展miRNAtap版本;稳定版请参见miRNAtap．

miRNAtap: microRNA目标-聚合预测

Bioconductor版本:开发(3.17)

该软件包促进了需要miRNA预测的工作流程的实现，它允许集成来自在线可用的多个来源的排名miRNA目标预测，并使用各种方法将其聚合，从而提高任何单一来源的预测质量。目前可以对智人、小家鼠和褐家鼠(最后一种通过同源翻译)进行预测。

作者:Maciej Pajak, T. Ian Simpson

维护者:T. Ian Simpson < Ian。辛普森在ed.ac.uk>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("miRNAtap")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“miRNAtap”)

PDF	R脚本	miRNAtap
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，微阵列，测序，软件，microrna的
版本	1.33.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(8.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.3.0)，AnnotationDbi
进口	DBI，RSQLite，stringr，sqldf，plyr、方法
链接
建议	topGO，org.Hs.eg.db，miRNAtap.db，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	miRNAtap.db
进口我	miRNAtap.db，SpidermiR
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	miRNAtap_1.33.0.tar.gz
Windows二进制	miRNAtap_1.33.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	miRNAtap_1.33.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	miRNAtap_1.33.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRNAtap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRNAtap
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/miRNAtap/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miRNAtap/
软件包下载报告	下载数据