miRLAB

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRLAB

这是发展miRLAB版本;稳定版请参见miRLAB．

探索miRNA-mRNA关系的干燥实验室

Bioconductor版本:开发(3.17)

提供探索miRNA- mrna关系的工具，包括流行的miRNA靶标预测方法，集成单个方法的集成方法，从在线资源获取数据的函数，验证结果的函数，以及进行富集分析的函数。

作者:Thuc Duy Le，张俊鹏，陈默，范越煌

维护人员:Thuc Duy Le

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("miRLAB")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression，网络，NetworkInference，软件，microrna的
版本	1.29.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(7.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	方法，统计，效用，RCurl，httr，stringr，Hmisc，能源，熵，gplots，glmnet，嫁祸于，limma，pcalg，TCGAbiolinks，dplyr，SummarizedExperiment，ctc，InvariantCausalPrediction，类别，GOstats，org.Hs.eg.db
链接
建议	knitr，BiocGenerics，AnnotationDbi，RUnit，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pvvhoang/miRLAB
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制	miRLAB_1.29.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRLAB
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miRLAB
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/miRLAB/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miRLAB/
软件包下载报告	下载数据