甲基管

doi：10.18129/b9.bioc.methylpipe

这是发展甲基管的版本；对于稳定版本，请参阅甲基管。

基础分辨率DNA甲基化数据分析

生物导体版本：开发（3.16）

CPG和非CPG序列上下文中基础分辨率DNA甲基化数据的记忆有效分析。从提供基础或低分辨率数据的任何方法中得出的DNA甲基化数据的整合。

作者：Kamal Kishore

维护者：kamal kishore

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“甲基pipe”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“甲基管”）

PDF	R脚本	甲基植物.pdf
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	覆盖范围，，，，DNAMETHYLATY，，，，甲基，，，，测序，，，，软件
版本	1.31.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（7。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看	r（> = 3.5.0），方法，grdevices，图形，统计，utils，基因组机，，，，总结性特征（> = 0.2.0），rsamtools
进口	Marray，，，，GPLOTS，，，，iranges，，，，生物基因，，，，GVIZ，，，，基因组签名，，，，生物弦， 平行，Data.Table，，，，GenomeInfodB，，，，S4VECTORS
链接
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown，，，，尼特，，，，甲基赛克
系统要求
增强
URL
取决于我	Listeretalbsseq
进口我	Compepitools
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	甲基Pipe_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	甲基Pipe_1.31.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	甲基Pipe_1.31.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylpipe
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲基管
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/methylpipe/
软件包下载报告	下载统计