methylInheritance

DOI:10.18129 / B9.bioc.methylInheritance

这是发展methylInheritance版本;稳定的发布版本,请参阅methylInheritance。

跨多个代Permutation-Based分析关联元素守恒的差异甲基化治疗效果

Bioconductor版本:发展(3.17)

排列分析、基于蒙特卡罗抽样测试的假设的数量守恒的差异甲基化元素,在几代人之间,相关联的效果继承自一个治疗和随机效应可以解雇。

作者:阿斯特丽德Deschenes (cre, aut)Pascal Belleau (aut)阿尔诺·所有权(aut)

维护人员:阿斯特丽德Deschenes < adeschen hotmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“methylInheritance”)

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HTML	R脚本	跨多个代Permutation-Based分析关联元素守恒的差异甲基化治疗效果
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细节

biocViews	BiologicalQuestion,DNAMethylation,DifferentialMethylation,表观遗传学,ImmunoOncology,MethylSeq,测序,软件,StatisticalMethod,WholeGenome
版本	1.23.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5)
进口	methylKit,BiocParallel,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors、方法、并行ggplot2,gridExtra,字谜
链接
建议	BiocStyle,BiocGenerics,knitr,rmarkdown,RUnit,methInheritSim
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/adeschen/methylInheritance
BugReports	https://github.com/adeschen/methylInheritance/issues
取决于我
进口我
建议我	methInheritSim
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	methylInheritance_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	methylInheritance_1.23.0.zip
macOS二进制(x86_64)	methylInheritance_1.23.0.tgz
macOS二进制(arm64)	methylInheritance_1.23.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylInheritance
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ methylInheritance
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/methylInheritance/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/methylInheritance/
包下载报告	下载数据