甲基葡萄酒

DOI：10.18129 / b9.bioc.methylgsa.

这是发展Methylgsa的版本;对于稳定的版本版本，请参阅甲基葡萄酒。

基因集分析使用差分甲基化的结果

Bioconducts版本：开发（3.14）

甲基菌的主要功能是甲基甲基和甲基溴。MethyLGSA实现调整探头数量的逻辑回归作为协变量。MethylRra通过稳健的级别聚集来调整每个基因的多个p值。有关更详细的帮助信息，请参阅Vignette。

作者：徐仁[自动化，CRE]，PEI Fen Kuan [Aut]

维护者：xu ren

安装

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if（！quoteNameSpace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）＃以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install（Version ='devel'）BiocManager :: Install（“MethyLGSA”）的使用

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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BROWSEVIGNETTES（“甲基甲基”）

HTML.	r script.	甲基甲基：DNA甲基化数据集的基因集分析
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	德甲基化那差分甲基化那GenereGulation.那GenesetenRichment.那途径那回归那软件
版本	1.11.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.8（R-3.5）（2.5岁）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.5）
进口	罗伯斯坦布格格焦那ggplot2.那stringr.，统计，ClusterProfiler.那MissMethyl.，org.hs.eg.db，reactome.db，生物相投，go.db，annotationdbi.那闪亮的，illuminahumanmethylation450ka​​nno.ilmn12.hg19，illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b4.hg19
链接到
建议	kn那RAMAMAMDOW.那testthat.那纪念碑
系统要求
加强
URL.	https://github.com/reese3928/methylgsa.
Bugreports.	https://github.com/reese3928/methylgsa/issues.
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包档案包

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源包	methylgsa_1.11.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	methylgsa_1.11.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/methylgsa.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/甲基麦
包短网址	https://biocumon.org/packages/methylgsa/
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