methylCC

这是发展methylCC版本;稳定的发布版本,请参阅methylCC。

估计全血在DNA甲基化的细胞组成样本

Bioconductor版本:发展(3.17)

一个工具来估计DNA甲基化的细胞组成全血样品测量技术(芯片和测序)在任何平台。

作者:斯蒂芬妮·c·希克斯(aut (cre)拉斐尔•伊(aut)

维护人员:斯蒂芬妮·c·希克斯< shicks19 jhu.edu >

从内部引用(R,回车引用(“methylCC”)):

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“methylCC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“methylCC”)

biocViews	DNAMethylation,MethylSeq,MethylationArray,微阵列,测序,软件,WholeGenome
版本	1.13.1
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6),FlowSorted.Blood.450k
进口	Biobase,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,dplyr,magrittr,minfi,bsseq,quadprog,plyranges,统计,跑龙套,bumphunter,genefilter、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19
链接
建议	rmarkdown,knitr,testthat(> =魅惑,BiocGenerics,BiocStyle,tidyr,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
BugReports	https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

遵循bob 体育网址指示在R会话中使用这个包。

源包	methylCC_1.13.1.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)	methylCC_1.13.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylCC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ methylCC
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/methylCC/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/methylCC/
包下载报告	下载数据

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