metapod

DOI:10.18129 / B9.bioc.metapod

这是发展元足部版本;稳定版请参见metapod．

微分分析p值的元分析

Bioconductor版本:开发(3.16)

实现了在基因组尺度数据集的差异分析中组合p值的各种方法。功能可以组合同一分析中不同测试的p值(例如，ChIP-seq中的基因组窗口，RNA-seq中的外显子)，或用于不同分析中的相应测试(例如，重复比较，不同处理条件的影响)。支持在适当的情况下处理日志转换的输入p值、缺失值和加权。

作者:Aaron Lun [aut, cre]

维护者:Aaron Lun 的键盘

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("metapod")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“metapod”)

超文本标记语言	R脚本	荟萃分析策略
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialPeakCalling，MultipleComparison，软件
版本	1.5.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
全靠我
进口我	csaw，mumosa，食物
建议我	TSCAN
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	metapod_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	metapod_1.5.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	metapod_1.5.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metapod
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metapod
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/metapod/
软件包下载报告	下载数据