metagene2

doi：10.18129/b9.bioc.metagene2

这是发展Metagene2的版本;对于稳定版本，请参阅metagene2。

生产metagene地块的包装

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包产生了元原子图，以比较选定基因组区域的测序实验的覆盖范围。它可用于评估启动子区域DNA相互作用蛋白的结合或在基因长度上测量反义转录的分析。METAGENE2软件包可以管理分析的各个方面，从覆盖范围的归一化到绘图面，根据实验元数据。Bootstraping Analysis用于提供按样本平均覆盖率的置信区间。

作者：Eric Fournier [CRE，AUT]，Charles Joly Beauparlant [aut]，Cedric Lippens [aut]，Arnaud Droit [aut]

维护者：yahoo.ca>的Eric Fournier

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ metagene2”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ metagene2”）

html	R脚本	Metagene2简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	结盟，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，遗传学，，，，多重组合，，，，测序，，，，软件
版本	1.13.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（3.5岁）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 4.0），R6（> = 2.0），基因组机，，，，生物比较
进口	rtracklayer， 工具，基因组签名，，，，GenomeInfodB，，，，iranges，，，，GGPLOT2，，，，rsamtools，，，，purrr，，，，Data.Table， 方法，dplyr，，，，马格里特，，，，RESHAPE2
链接
建议	生物基因，，，，运行，，，，尼特，，，，生物使用，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/arnauddroitlab/metagene2
BugReports	https://github.com/arnauddroitlab/metagene2/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	metagene2_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	metagene2_1.13.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	metagene2_1.13.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metagene2
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/metagene2
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/metagene2/
软件包下载报告	下载统计