metagene

doi：10.18129/b9.bioc.metagene

这是发展Metagene的版本；对于稳定版本，请参阅metagene。

生产metagene地块的包装

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包产生了元原子图，以比较选定基因/特征组的DNA相互作用蛋白的行为。BAM文件用于增加分辨率。可以在单个分析中比较一组BAM文件和/或基因组区域组的多重组合。Bootstraping分析用于比较各组并找到具有统计学上不同富集曲线的区域。

作者：Charles Joly Beauparlant ，Fabien Claude Lamaze ，Rawane samb 在ulaval.ca>，Cedric Lippens cedric Lippens

维护者：Charles Joly Beauparlant

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ metagene”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Metagene”）

html	R脚本	Metagene简介
html	R脚本	RNA-Seq Exp
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	结盟，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，遗传学，，，，多重组合，，，，测序，，，，软件
版本	2.29.0
在生物导体中	Bioc 3.0（R-3.1）（8年）
执照	Artistic-2.0 |文件执照
要看	r（> = 3.5.0），R6（> = 2.0），基因组机，，，，生物比较
进口	rtracklayer，，，，GPLOTS， 工具，基因组签名，，，，GenomeInfodB，，，，GenomicFeatures，，，，iranges，，，，GGPLOT2，必须rsamtools，，，，矩阵，，，，purrr，，，，Data.Table，，，，马格里特，方法，utils，Ensembldb，，，，ensdb.hsapiens.v86，，，，Stringr
链接
建议	生物基因，，，，相似，，，，运行，，，，尼特，，，，生物使用，，，，rmarkDown，，，，相似
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/charlesjb/metagene/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	metagene_2.29.0.tar.gz
Windows二进制	metagene_2.29.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	metagene_2.29.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metagene
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/metagene
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/metagene/
软件包下载报告	下载统计