metabolomicsWorkbenchR

DOI:10.18129 / B9.bioc.metabolomicsWorkbenchR

这是发展metabolomicsWorkbenchR版本;稳定的发布版本,请参阅metabolomicsWorkbenchR

代谢组学R中的工作台

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包提供了功能与代谢组学工作台RESTful API。研究、化合物、蛋白质和基因信息可以使用API搜索。方法获取研究数据等公共Bioconductor格式SummarizedExperiment和MultiAssayExperiment也包括在内。

作者:加文·里斯•劳埃德(aut (cre),拉尔夫约翰内斯·玛丽亚·韦伯(aut)

维修工:加文·里斯•劳埃德<广义相对论。劳埃德在bham.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“metabolomicsWorkbenchR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“metabolomicsWorkbenchR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“metabolomicsWorkbenchR”)

HTML R脚本 例子使用structToolbox
HTML R脚本 Introduction_to_metabolomicsWorkbenchR
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 代谢组学,软件
版本 1.9.0
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 4.0)
进口 data.table,httr,jsonlite、方法、MultiAssayExperiment,结构体,SummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议 BiocStyle,covr,knitr,HDF5Array,rmarkdown,structToolbox,testthat,pmp、网格png
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 fobitools
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.zip
macOS二进制(x86_64) metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.tgz
macOS二进制(arm64) metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabolomicsWorkbenchR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ metabolomicsWorkbenchR
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/metabolomicsWorkbenchR/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/metabolomicsWorkbenchR/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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