metabolomicsWorkbenchR

DOI:10.18129 / B9.bioc.metabolomicsWorkbenchR

这是发展metabolomicsWorkbenchR版本;稳定的发布版本,请参阅metabolomicsWorkbenchR。

代谢组学R中的工作台

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包提供了功能与代谢组学工作台RESTful API。研究、化合物、蛋白质和基因信息可以使用API搜索。方法获取研究数据等公共Bioconductor格式SummarizedExperiment和MultiAssayExperiment也包括在内。

作者:加文·里斯•劳埃德(aut (cre),拉尔夫约翰内斯·玛丽亚·韦伯(aut)

维修工:加文·里斯•劳埃德<广义相对论。劳埃德在bham.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“metabolomicsWorkbenchR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“metabolomicsWorkbenchR”)

HTML	R脚本	例子使用structToolbox
HTML	R脚本	Introduction_to_metabolomicsWorkbenchR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	代谢组学,软件
版本	1.9.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	data.table,httr,jsonlite、方法、MultiAssayExperiment,结构体,SummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,covr,knitr,HDF5Array,rmarkdown,structToolbox,testthat,pmp、网格png
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	fobitools
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.zip
macOS二进制(x86_64)	metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.tgz
macOS二进制(arm64)	metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabolomicsWorkbenchR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ metabolomicsWorkbenchR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/metabolomicsWorkbenchR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/metabolomicsWorkbenchR/
包下载报告	下载数据