墨西拿

DOI:10.18129 / B9.bioc.messina

这是发展墨西拿版本;稳定版请参见墨西拿

单基因分类器和抗异常值检测差异表达的两组和生存问题

Bioconductor版本:开发(3.17)

墨西拿是一组算法,用于构建最优鲁棒单基因分类器,并用于在异常值或未知样本子组存在时识别差异表达。这些方法可应用于识别先导特征,以发展为临床试验(诊断和预后),以及在部分样本显示不寻常表达模式时识别差异表达。

作者:Mark Pinese [aut], Mark Pinese [cre], Mark Pinese [cph]

维护者:Mark Pinese

引文(从R内,输入引用(“墨西拿”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("messina")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“墨西拿”)

PDF R脚本 使用墨西拿
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BiomedicalInformatics分类DifferentialExpressionGeneExpression软件生存
版本 1.35.0
在Bioconductor BioC 2.14 (R-3.1)(9年)
许可证 Epl (>= 1.0)
取决于 R (>= 3.1.0),生存(>= 2.37-4),方法
进口 Rcpp(> = 0.11.1),plyr(> = 1.8),ggplot2(>= 0.9.3.1),网格(>= 3.1.0),foreach(>= 1.4.1),图形
链接 Rcpp
建议 knitr(> = 1.5),antiProfilesData(> = 0.99.2),Biobase(> = 2.22.0),BiocStyle
SystemRequirements
增强了 doMC(> = 1.3.3)
URL
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 messina_1.35.0.tar.gz
Windows二进制 messina_1.35.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) messina_1.35.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) messina_1.35.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/messina
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/messina
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/messina/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/messina/
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