网眼

doi：10.18129/b9.bioc.meshes

这是发展网格的版本；对于稳定版本，请参阅网眼。

网格丰富和语义分析

生物导体版本：开发（3.16）

网格（医学主题标题）是用于手动索引Medline/PubMed索引文章的NLM受控词汇。网格术语与Entrez基因ID相关联，三种方法Gendoo，Gene2pubmed和RBBH。该关联对于富集和语义分析至关重要。网格支持基因列表或整个表达谱的富集分析（过度占代表和基因集富集分析）。网格术语的语义比较提供了计算基因和基因组之间相似性的定量方法。网格分别实施了Resnik，Schlicker，Jiang，Lin和Wang提出的五种方法，并支持70多种。

作者：广琴Yu [AUT，CRE]，Erqiang Hu [CTB]

维护者：gmail.com> guangchuang yu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ meshes”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“网格”）

html	R脚本	网眼
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，聚类，，，，多重组合，，，，软件
版本	1.23.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.1.0）
进口	AnnotationDbi，，，，剂量，，，，富集，，，，Gosemsim，方法，utils，AnnotationHub，，，，Meshdbi，，，，Yulab.utils
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，Prettydoc
系统要求
增强
URL	https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/
BugReports	https://github.com/guangchuangyu/meshes/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	meshes_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	meshes_1.23.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	meshes_1.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/meshes
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/网格
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/meshes/
软件包下载报告	下载统计