mbkmeans
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doi：10.18129/b9.bioc.mbkmeans
这是发展Mbkmeans的版本；对于稳定版本，请参阅mbkmeans。
小批量K-均值聚类用于单细胞RNA-Seq
生物导体版本：开发（3.16）
实现用于大型数据集的迷你批次K-均值算法，包括对磁盘数据表示的支持。
作者：Yuwei Ni [AUT，CPH]，Davide Risso [AUT，CRE，CPH]，Stephanie Hicks [AUT，CPH]，Elizabeth Purdom [AUT，CPH]
维护者：davide risso
引用（从r内，输入引用（“ mbkmeans”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ mbkmeans”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Mbkmeans”）
| html | R脚本 | mbkmeans vignette |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 聚类，，，，基因表达，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学 |
| 版本 | 1.13.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（3年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | 方法，延迟，，，，RCPP，，，，S4VECTORS，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，clusterr，，，，基准，，，，矩阵，，，，生物比较 |
| 链接 | RCPP，，，，rcpparmadillo（> = 0.7.2），Rhdf5lib，，，，beachmat，，，，clusterr |
| 建议 | beachmat，，，，HDF5Array，，，，Rhdf5lib，，，，生物使用，，，，tenxpbmcdata，，，，评分，，，，延迟的matrixstats，，，，Bluster，，，，尼特，，，，测试，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/drisso/mbkmeans/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 簇发酵 |
| 建议我 | Bluster，，，，scdblfinder |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | mbkmeans_1.13.0.tar.gz |
| Windows二进制 | mbkmeans_1.13.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbkmeans |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/mbkmeans |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mbkmeans/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
