mbOmic

DOI:10.18129 / B9.bioc.mbOmic

这是发展mbOmic版本;稳定版请参见mbOmic．

微生物组和代谢组的综合分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

mbOmic包包含一组微生物组学和代谢组学数据分析函数，用于分析微生物和代谢产物之间的组间相关性。微生物组和代谢组的综合分析是mbOmic的目标。此外，初步实现了利用肠道菌群丰度进行肠型鉴定。

作者:龚聪聪[aut, cre]

维护人员:congcongong

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("mbOmic")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“mbOmic”)

超文本标记语言	R脚本	enterotyping
超文本标记语言	R脚本	代谢组和微生物组的综合分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	代谢组学，微生物组，网络，软件
版本	1.3.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1.0)
进口	平行,doParallel，心理，WGCNA，data.table，igraph，visNetwork，集群，clusterSim，方法，图形，统计
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),knitr，rmarkdown，devtools，嫁祸于
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/gongcongcong/mbOmic
BugReports	https://github.com/gongcongcong/mbOmic/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	mbOmic_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	mbOmic_1.3.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	mbOmic_1.3.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	mbOmic_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbOmic
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mbOmic
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/mbOmic/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mbOmic/
软件包下载报告	下载数据