marray

DOI:10.18129 / B9.bioc.marray

这是发展marray版本;稳定的发布版本,请参阅marray。

探索性分析可以发现微阵列数据

Bioconductor版本:发展(3.17)

类定义为双色发现微阵列数据。数据输入功能,诊断情节、标准化和质量检查。

作者:绮华(Jean)杨在maths.usyd.edu.au > < jeany Agnes Paquet和Sandrine Dudoit。

杨维护者:绮华(Jean) <珍biostat.ucsf.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“marray”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“marray”)

PDF	R脚本	marray正常化
PDF	R脚本	marray概述
PDF	R脚本	marrayClasses概述
PDF	R脚本	marrayClasses教程(短)
PDF	R脚本	marrayInput介绍
PDF	R脚本	marrayPlots概述
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	微阵列,预处理,软件,TwoChannel
版本	1.77.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = 2.10.0),limma、方法
进口
链接
建议	tkWidgets
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.maths.usyd.edu.au/u/jeany/
取决于我	beta7,CGHbase,转换,dyebias,dyebiasexamples,maigesPack,MineICA,nnNorm,奥林,遏制,stepNorm,TurboNorm
进口我	arrayQuality,冠军,methylPipe,MSstats,MSstatsShiny,nnNorm,奥林,OLINgui,钢琴,stepNorm,timecourse
建议我	AgiMicroRna,DEGraph,Mfuzz
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	marray_1.77.0.tar.gz
Windows二进制	marray_1.77.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	marray_1.77.0.tgz
macOS二进制(arm64)	marray_1.77.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/marray
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ marray
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/marray/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/marray/
包下载报告	下载数据