macat

DOI:10.18129 / B9.bioc.macat

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这是发展macat版本;稳定的发布版本,请参阅macat。

微阵列染色体分析工具

Bioconductor版本:发展(3.18)

这个库包含函数来研究基因差异表达之间的联系和基因的染色体定位。MACAT是出于共同的观察现象涉及大型肿瘤细胞的染色体区域。MACAT是统计方法的实现对于识别差异表达显著的染色体区域。功能测试在一个公开的数据集对急性淋巴细胞白血病(杨紫琼et al.Cancer细胞2002),这是在图书馆提供“stjudem”。

作者:本杰明·格奥尔基马提亚Heinig, Stefan Roepcke Sebastian Schmeier Joern Toedling

维护人员:Joern Toedling < jtoedling在yahoo.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“macat”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“macat”)

PDF	R脚本	微阵列染色体分析工具
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,微阵列,软件,可视化
版本	1.75.1
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 18岁)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase,注释
进口
链接
建议	hgu95av2.db,stjudem
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	macat_1.75.1.tar.gz
Windows二进制	macat_1.75.1.zip
macOS二进制(x86_64)	macat_1.75.1.tgz
macOS二进制(arm64)	macat_1.75.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/macat
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ macat
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/macat/
包下载报告	下载数据