MCSEA
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doi：10.18129/b9.bioc.mcsea
这是发展MCSEA的版本；对于稳定版本，请参阅MCSEA。
甲基化的CPG集富集分析
生物导体版本：开发（3.16）
使用Illumina的450K或Epic微阵列数据，从人类基因组中鉴定了预定义区域（启动子，CpG岛...）中差异甲基化区域（DMR）的鉴定。提供基于线性模型对CPG探针进行排名的方法，并包括绘图功能。
作者：Jordi Martorell-Marugán和Pedro Carmona-Sáez
维护者：jordi martorell-marugán
引用（从r内，输入引用（“ MCSEA”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ mcSea”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ MCSEA”）
| R脚本 | 使用MCSEA软件包的预定义DMR识别 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | DNAMETHYLATY，，，，差甲基化，，，，表观遗传学，，，，遗传学，，，，基因数，，，，免疫学，，，，甲基化array，，，，微阵列，，，，多重组合，，，，软件，，，，两通道 |
| 版本 | 1.17.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（4。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 3.5），McSeadata，，，，同性恋 |
| 进口 | Biomart，，，，fgsea，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，GGPLOT2，图形，grdevices，GVIZ，，，，iranges，，，，林玛，方法，并行，S4VECTORS，统计总结性特征，UTILS |
| 链接 | |
| 建议 | 生物酶，，，，生物基因，，，，生物使用，，，，Flowsorted.blood.450k，，，，尼特，，，，白血病，，，，Minfi，，，，Minfidata，，，，rmarkDown，，，，运行 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | Shinyepico |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | mcSea_1.17.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MCSEA_1.17.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | MCSEA_1.17.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mcsea |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/mcSea |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mcsea/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
