- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- mBPCR(开发版)
mBPCR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.mBPCR
这是发展mBPCR版本;稳定的发布版本,请参阅mBPCR。
贝叶斯分段常数回归进行DNA拷贝数的估计
Bioconductor版本:发展(3.17)
它包含函数估计的DNA拷贝数概要文件使用mBPCR,目的是检测拷贝数变化的地区。
作者:P.M.V. Rancoita < Rancoita。在gmail.com paola >,with contributions from M. Hutter
维护人员:P.M.V. Rancoita < Rancoita。在gmail.com paola >
从内部引用(R,回车引用(“mBPCR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“mBPCR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“mBPCR”)
| R脚本 | mBPCR | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | CopyNumberVariation,微阵列,单核苷酸多态性,软件,aCGH |
| 版本 | 1.53.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(13岁) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | oligoClasses,GWASTools |
| 进口 | Biobase、图形方法,跑龙套,grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | xtable |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.idsia.ch/ ~ paola / mBPCR |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | mBPCR_1.53.0.tar.gz |
| Windows二进制 | mBPCR_1.53.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | mBPCR_1.53.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | mBPCR_1.53.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mBPCR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mBPCR |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/mBPCR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/mBPCR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
