m6Aboost

DOI:10.18129 / B9.bioc.m6Aboost

这是发展m6Aboost版本;稳定的发布版本,请参阅m6Aboost。

m6Aboost

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包可以帮助用户自行运行m6Aboost模型miCLIP2数据。包包含函数分配阅读数量和运行m6Aboost模型的特性。miCLIP2数据应该存储在一个农庄组织对象。可以找到更多细节的装饰图案。

作者:你周(aut (cre),凯瑟琳Zarnack (aut)

维护人员:你周< youzhoulearning gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“m6Aboost”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“m6Aboost”)

HTML	R脚本	m6Aboost小插曲
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	表观遗传学,ExperimentHubSoftware,遗传学,测序,软件
版本	1.5.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	S4Vectors,adabag,GenomicRangesR (> = 4.1)
进口	dplyr,rtracklayer,BSgenome,Biostrings、跑龙套、方法IRanges,ExperimentHub
链接
建议	knitr,rmarkdown,bookdown,testthat,BiocStyle,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ZarnackGroup/m6Aboost
BugReports	https://github.com/ZarnackGroup/m6Aboost/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	m6Aboost_1.5.0.tar.gz
Windows二进制	m6Aboost_1.5.0.zip
macOS二进制(x86_64)	m6Aboost_1.5.0.tgz
macOS二进制(arm64)	m6Aboost_1.5.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/m6Aboost
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ m6Aboost
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/m6Aboost/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/m6Aboost/
包下载报告	下载数据