limmaGUI

DOI:10.18129 / B9.bioc.limmaGUI

这是发展limmaGUI版本;稳定的发布版本,请参阅limmaGUI。

GUI对limma包有两个颜色的微阵列

Bioconductor版本:发展(3.18)

图形用户界面的微分表达式使用limma包成微阵列数据的分析。

作者:詹姆斯Wettenhall (aut)戈登·史密斯(aut),基思Satterley(施)

维护人员:戈登史密斯<史密斯在wehi.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“limmaGUI”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“limmaGUI”)

HTML		about.html
HTML		CustMenu.html
PDF		提取从limmaGUI limma对象文件
HTML		import.html
HTML		index . html
HTML		InputFiles.html
HTML		lgDevel.html
PDF	R脚本	limmaGUI装饰图案
PDF		LinModIntro.pdf
HTML		windowsFocus.html
PDF		参考手册

细节

biocViews	BatchEffect,贝叶斯,DataImport,DifferentialExpression,GUI,GeneExpression,微阵列,MultipleComparison,归一化,预处理,质量控制,回归,软件,TimeCourse,TwoChannel,mRNAMicroarray
版本	1.77.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 18岁)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	方法、grDevices图形,limma,tcltk R2HTML tkrplot xtable,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://bioinf.wehi.edu.au/limmaGUI/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	limmaGUI_1.77.0.tar.gz
Windows二进制	limmaGUI_1.77.0.zip
macOS二进制(x86_64)	limmaGUI_1.77.0.tgz
macOS二进制(arm64)	limmaGUI_1.77.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/limmaGUI
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ limmaGUI
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/limmaGUI/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/limmaGUI/
包下载报告	下载数据