这是发展Kissde的版本;对于稳定版本,请参阅亲。
生物导体版本:开发(3.16)
检索RNA-seq数据中的条件特异性变体(SNV,替代拼写,Indels)。它已被开发为“ Kissplice”的后处理,但也可以与用户自己的数据一起使用。
作者:Clara Benoit-Pilven [aut],Camille Marchet [aut],Janice Kielbassa [aut],Lilia Brinza [aut],Audric Cologne [aut],AurélieSiberchicot [aut,CRE],Vincent Lacroix [Aut],Frank Picard,Frank Picard[CTB],Laurent Jacob [CTB],Vincent Miele [CTB]
维护者:AurélieSiberchicot
引用(从r内,输入引用(“ Kissde”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ kissde”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Kissde”)
R脚本 | kissde.pdf | |
参考手册 |
生物浏览 | 替代方案,,,,差速器,,,,实验设计,,,,基因组变量,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录组学 |
版本 | 1.17.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(4年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | AODS3,,,,生物酶,,,,deseq2,,,,DSS,,,,GGPLOT2,,,,GPLOTS,图形,grdevices,矩阵,统计,utils,foreach,,,,多帕尔, 平行,闪亮的,,,,Shinycsssloaders,,,,ADE4,,,,事实,,,,DT |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Kissde_1.17.0.tar.gz |
Windows二进制 | KISSDE_1.17.0.ZIP |
MacOS 10.13(高山脉) | KISSDE_1.17.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kissde |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/kissde |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/kissde/ |
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