doi:10.18129/b9.bioc.kis​​sde

这是发展Kissde的版本;对于稳定版本,请参阅

检索RNA-seq数据中的条件特异性变体

生物导体版本:开发(3.16)

检索RNA-seq数据中的条件特异性变体(SNV,替代拼写,Indels)。它已被开发为“ Kissplice”的后处理,但也可以与用户自己的数据一起使用。

作者:Clara Benoit-Pilven [aut],Camille Marchet [aut],Janice Kielbassa [aut],Lilia Brinza [aut],Audric Cologne [aut],AurélieSiberchicot [aut,CRE],Vincent Lacroix [Aut],Frank Picard,Frank Picard[CTB],Laurent Jacob [CTB],Vincent Miele [CTB]

维护者:AurélieSiberchicot

引用(从r内,输入引用(“ Kissde”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ kissde”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Kissde”)

PDF R脚本 kissde.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 替代方案,,,,差速器,,,,实验设计,,,,基因组变量,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.17.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4年)
执照 GPL(> = 2)
要看
进口 AODS3,,,,生物酶,,,,deseq2,,,,DSS,,,,GGPLOT2,,,,GPLOTS,图形,grdevices,矩阵,统计,utils,foreach,,,,多帕尔, 平行,闪亮的,,,,Shinycsssloaders,,,,ADE4,,,,事实,,,,DT
链接
建议 生物使用,,,,测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Kissde_1.17.0.tar.gz
Windows二进制 KISSDE_1.17.0.ZIP
MacOS 10.13(高山脉) KISSDE_1.17.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kissde
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/kissde
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/kissde/
软件包下载报告 下载统计

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