ipdDb

DOI:10.18129 / B9.bioc.ipdDb

这是发展ipdDb版本;稳定的发布版本,请参阅ipdDb。

IPD IMGT / HLA和IPD吉珥数据库智人

Bioconductor版本:发展(3.16)

所有从IPD IMGT / HLA等位基因和IPD吉珥数据库智人。上海黄金交易所参考:罗宾逊J, Maccari G,沼泽,沃尔特·L Blokhuis J, Bimber B, Parham P, De Groot NG Bontrop再保险公司Guethlein洛杉矶,和哈蒙德JA吉珥命名法非人类物种的免疫遗传学(2018),在准备。

作者:史蒂芬Klasberg

维护人员:史蒂芬Klasberg < Klasberg在dkms-lab.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ipdDb”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ipdDb”)

HTML	R脚本	ipdDb
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationHubSoftware,DataRepresentation,GenomicVariation,SequenceMatching,软件,VariantAnnotation
版本	1.15.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.5.0)、方法AnnotationDbi(> = 1.43.1),AnnotationHub
进口	Biostrings,GenomicRanges,RSQLite,DBI,IRanges统计数据,为了
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/DKMS-LSL/ipdDb
BugReports	https://github.com/DKMS-LSL/ipdDb/issues/new
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ipdDb_1.15.0.tar.gz
Windows二进制	ipdDb_1.15.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ipdDb_1.15.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ipdDb
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ipdDb
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ipdDb/
包下载报告	下载数据