这是发展idpr版本;稳定的发布版本,请参阅idpr。
Bioconductor版本:发展(3.18)
“idpr”旨在集成工具的计算分析内在无序蛋白质(idp) r .这个包是用来识别已知特征的国内流离失所者感兴趣的序列与轻松地报道和动态结果。此外,这个包包含工具IDP-based序列分析与其他R包一起使用。麦克费登WM中描述& Yanowitz杰(2022)。“idpr:方案分析和分析内在无序蛋白质>PloS one, 17(4), e0266929.
作者:威廉·m·麦克费登(cre, aut],朱迪斯·l·Yanowitz aut,曾经,迈克尔Buszczak(施,曾经)
维护人员:威廉·m·麦克费登在pitt.edu < wmm27 >
从内部引用(R,回车引用(“idpr”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“idpr”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“idpr”)
HTML | R脚本 | 电荷和水疗法装饰图案 |
HTML | R脚本 | 无序矩阵装饰图案 |
HTML | R脚本 | 装饰图案idpr方案概述 |
HTML | R脚本 | IUPred装饰图案 |
HTML | R脚本 | 序列图装饰图案 |
HTML | R脚本 | 装饰图案结构趋势 |
参考手册 |
biocViews | CellBiology,蛋白质组学,软件,StructuralPrediction |
版本 | 1.11.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年) |
许可证 | LGPL (> = 3) |
取决于 | R (> = 4.1.0) |
进口 | ggplot2 (> = 3.3.0) magrittr (> = 1.5), dplyr (> = 0.8.5) plyr (> = 1.8.6) jsonlite (> = 1.6.1) rlang (> = 0.4.6),Biostrings(> = 2.56.0)、方法(> = 4.0.0) |
链接 | |
建议 | knitr rmarkdown,msa、猿、testthat seqinr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/wmm27/idpr/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | idpr_1.11.0.tar.gz |
Windows二进制 | idpr_1.11.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | idpr_1.11.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/idpr |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ idpr |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/idpr/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/idpr/ |
包下载报告 | 下载数据 |