理想的

doi：10.18129/b9.bioc.deal

这是发展理想的版本；对于稳定版本，请参阅理想的。

交互式差异表达分析

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包为RNA序列数据集的交互式差分表达分析提供了功能，以快速有效地提取下游差异表达的步骤。闪亮的应用程序封装了整个软件包。

作者：费德里科·马里尼（Federico Marini）[AUT，CRE]

维护者：uni-mainz.de>的Federico Marini

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“理想”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“理想”）

html	R脚本	理想用户指南
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	差异性，，，，GUI，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，免疫学，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.21.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（5年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	topgo
进口	deseq2，，，，总结性特征，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，GGPLOT2（> = 2.0.0），热图，，，，情节，，，，pheatmap，，，，PCAEXPLORER，，，，ihw，，，，GPLOTS，，，，insctr，，，，Goseq，，，，Stringr，，，，dplyr，，，，林玛，，，，gostats，，，，go.db，，，，AnnotationDbi，，，，闪亮的（> = 0.12.0），发光的dashboard，，，，丝绸，，，，DT，，，，Rentrez，，，，Rintrojs，，，，rlang，，，，Ggrepel，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，闪亮，，，，生物比较，grdevices，base64enc， 方法
链接
建议	测试，，，，生物使用，，，，呼吸道，，，，org.hs.eg.db，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown，，，，变形，，，，EDGER
系统要求
增强
URL	https://github.com/federicomarini/idealhttps://federicomarini.github.io/ideal/
BugReports	https://github.com/federicomarini/ideal/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Ideal_1.21.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）	Ideal_1.21.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ideal
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/理想
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/ideal/
软件包下载报告	下载统计