iSEEu

DOI:10.18129 / B9.bioc.iSEEu

这是发展iSEEu版本;稳定的发布版本,请参阅iSEEu。

iSEE宇宙

Bioconductor版本:发展(3.16)

iSEEu (iSEE宇宙)包含不同的功能扩展的使用方案,包括面板、额外的类或模式允许容易iSEE应用程序的配置。

作者:凯文Rue-Albrecht (aut (cre),夏洛特Soneson (aut),费德里科•马里尼(aut)亚伦Lun (aut)迈克尔·施(施)

维护人员:凯文Rue-Albrecht < kevinrue67 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“iSEEu”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“iSEEu”)

HTML	R脚本	面板的宇宙
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays,聚类,DimensionReduction,FeatureExtraction,GUI,GeneExpression,ImmunoOncology,SingleCell,软件,转录,转录组,可视化
版本	1.9.3
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	iSEE,iSEEhex
进口	方法,S4Vectors,IRanges,闪亮的,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,ggplot2,DT统计数据,colourpicker,shinyAce
链接
建议	scRNAseq,嘘,食物,气道,刨边机,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db,GO.db,KEGGREST,knitr,igraph,rmarkdown,BiocStyle,htmltools,Rtsne,uwot,testthat(> =魅惑,covr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/iSEE/iSEEu
BugReports	https://github.com/iSEE/iSEEu/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	iSEEu_1.9.3.tar.gz
Windows二进制	iSEEu_1.9.3.zip
macOS二进制(x86_64)	iSEEu_1.9.3.tgz
macOS二进制(arm64)	iSEEu_1.9.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iSEEu
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ iSEEu
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/iSEEu/
包下载报告	下载数据