iSEEhub

DOI:10.18129 / B9.bioc.iSEEhub

这是发展iSEEhub版本;稳定版请参见iSEEhub．

生物导体实验的iSEE

Bioconductor版本:开发(3.17)

这个包定义了一个用于iSEE应用程序与Bioconductor ExperimentHub接口的自定义登录页。登录页面允许用户浏览ExperimentHub，选择一个数据集，下载并缓存它，并直接导入到Bioconductor iSEE应用程序。

作者:Kevin Rue-Albrecht [aut, cre]

维护者:Kevin Rue-Albrecht

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("iSEEhub")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“iSEEhub”)

超文本标记语言	R脚本	为iSEEhub做贡献
超文本标记语言	R脚本	iSEEhub简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，ImmunoOncology，基础设施，SingleCell，软件
版本	1.1.1
在Bioconductor	BioC 3.16 (R-4.2)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	SummarizedExperiment，SingleCellExperiment，ExperimentHub
进口	AnnotationHub，BiocManager，DT，iSEE、方法、rintrojs，S4Vectors，闪亮的，shinydashboard，shinyjs,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，covr，knitr，RefManageR，rmarkdown，sessioninfo，testthat(> = 3.0.0),nullrangesData
SystemRequirements
增强了	BioPlex，biscuiteerData，bodymapRat，CLLmethylation，CopyNeutralIMA，curatedAdipoArray，curatedAdipoChIP，curatedMetagenomicData，curatedTCGAData，DMRcatedata，DuoClustering2018，easierData，emtdata，epimutacionsData，FieldEffectCrc，GenomicDistributionsData，GSE103322，GSE13015，GSE62944，HDCytoData，HMP16SData，HumanAffyData，imcdatasets，mcsurvdata，MetaGxBreast，MetaGxOvarian，MetaGxPancreas，MethylSeqData，muscData，NxtIRFdata，ObMiTi，quantiseqr，restfulSEData，RLHub，sesameData，SimBenchData，SingleCellMultiModal，SingleMoleculeFootprintingData，spatialDmelxsim，STexampleData，TabulaMurisData，TabulaMurisSenisData，TENxVisiumData，tissueTreg，VectraPolarisData，xcoredata
URL	https://github.com/iSEE/iSEEhub
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/iSEEhub
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	iSEEhub_1.1.1.tar.gz
Windows二进制	iSEEhub_1.1.1.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	iSEEhub_1.1.1.tgz
macOS二进制文件(arm64)	iSEEhub_1.1.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iSEEhub
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/iSEEhub
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/iSEEhub/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/iSEEhub/
软件包下载报告	下载数据