iGC

DOI:10.18129 / B9.bioc.iGC

这是发展iGC的版本;稳定的发布版本,请参阅iGC。

一个集成分析的基因表达和拷贝数改变

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包的目的是识别差异表达基因的拷贝数变化与基因表达和CNA数据样本。

作者:Yi-Pin赖(aut)梁波著王(aut (cre) Tzu-Pin陆(aut),埃里克·y壮族(aut)

维护人员:王梁波著< r02945054在ntu.edu.tw >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(iGC)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (iGC)

HTML	R脚本	iGC概论
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文本		新闻

细节

biocViews	AssayDomain,生物问题,CopyNumberVariation,DifferentialExpression,GeneExpression,遗传学,GenomicVariation,微阵列,MultipleComparison,ResearchField,测序,软件,技术,WorkflowStep
版本	1.29.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.2.0)
进口	plyr,data.table
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了	doMC
URL	http://github.com/ccwang002/iGC
BugReports	http://github.com/ccwang002/iGC/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	iGC_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	iGC_1.29.0.zip
macOS二进制(x86_64)	iGC_1.29.0.tgz
macOS二进制(arm64)	iGC_1.29.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iGC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ iGC
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/iGC/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/iGC/
包下载报告	下载数据