hmdbQuery

DOI:10.18129 / B9.bioc.hmdbQuery

这是发展hmdbQuery版本;稳定的发布版本,请参阅hmdbQuery。

为探索人类代谢组数据库实用工具

Bioconductor版本:发展(3.17)

为探索人类代谢组的数据库定义工具,包括函数来检索特定的代谢物条目和数据快照与成对协会(metabolite-gene,蛋白质,疾病)。

作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“hmdbQuery”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“hmdbQuery”)

HTML	R脚本	hmdbQuery:与人类代谢组数据库(hmdb.ca)
PDF		参考手册

细节

biocViews	基础设施,代谢组学,软件
版本	1.19.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5),XML
进口	S4Vectors、方法、跑龙套
链接
建议	knitr,注释,gwascat,testthat,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	hmdbQuery_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	hmdbQuery_1.19.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	hmdbQuery_1.19.0.tgz
macOS二进制(arm64)	hmdbQuery_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hmdbQuery
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hmdbQuery
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/hmdbQuery/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hmdbQuery/
包下载报告	下载数据