hierGWAS

DOI:10.18129 / B9.bioc.hierGWAS

这是发展hierGWAS版本;稳定版请参见hierGWAS．

评估预见性GWA研究的统计显著性

Bioconductor版本:开发(3.17)

在GWA研究中，使用所有snp的联合模型测试单个snp以及任意大的snp组。该方法控制FWER，并提供自动的数据驱动的SNP集群细化到更小的组或单个标记。

作者:Laura Buzdugan

维护者:Laura Buzdugan < Buzdugan at stat.math.ethz.ch>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("hierGWAS")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“hierGWAS”)

PDF	R脚本	R-Package hierGWAS用户手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，LinkageDisequilibrium，单核苷酸多态性，软件
版本	1.29.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(7.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.2.0)
进口	fastcluster，glmnet，fmsb
链接
建议	BiocGenerics，RUnit，质量
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	hierGWAS_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	hierGWAS_1.29.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	hierGWAS_1.29.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	hierGWAS_1.29.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hierGWAS
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/hierGWAS
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/hierGWAS/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hierGWAS/
软件包下载报告	下载数据