的热图

DOI:10.18129 / B9.bioc.heatmaps

这是发展版本的热图;稳定的发布版本,请参阅的热图。

灵活的热图序列为功能基因组学和功能

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包提供函数来绘制的热图跨基因组的全基因组数据的间隔,如ChIP-seq信号的峰值和推动者。许多功能也提供调查序列特性。

作者:马尔科姆·佩里在gmail.com < mgperry32 >

维护人员:马尔科姆·佩里在gmail.com < mgperry32 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“热图”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“热图”)

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文本		新闻

细节

biocViews	FunctionalGenomics,SequenceMatching,软件,可视化
版本	1.23.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	方法、grDevices图形,统计数据,Biostrings,GenomicRanges,IRanges,KernSmooth,plotrix,矩阵,EBImage,RColorBrewer,BiocGenerics,GenomeInfoDb
链接
建议	BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	seqArchRplus
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	heatmaps_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	heatmaps_1.23.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	heatmaps_1.23.0.tgz
macOS二进制(arm64)	heatmaps_1.23.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/heatmaps
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/热图
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/heatmaps/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/heatmaps/
包下载报告	下载数据