杂环胺

DOI:10.18129 / B9.bioc.hca

这是发展hca的版本;稳定的发布版本,请参阅杂环胺。

探索人类细胞图谱数据协调平台

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包为用户提供查询人类细胞的能力阿特拉斯单细胞实验数据的数据存储库。“项目()”,“文件()”,“样品()”和“包()”功能在每个索引检索摘要信息;相应的‘* _details()可用于个人的每个索引条目。基于文件的资源可以下载使用“files_download ()”。先进的使用方案允许用户通过大型结果集页面,并灵活查询链表的链表的结构代表查询响应。

作者:玛雅麦克丹尼尔(aut),马丁·摩根(aut (cre),凯拉Interdonato(施)

维修工:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(hca)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (hca)

HTML	R脚本	访问人类细胞图谱数据
HTML	R脚本	与人类细胞图谱表现
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	SingleCell,软件
版本	1.7.1上
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.1)
进口	httr,jsonlite,dplyr,宠物猫,tidyr,readr,BiocFileCache、工具、跑龙套消化,闪亮的,miniUI,DT
链接
建议	LoomExperiment,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,S4Vectors、方法、testthat(> = 3.0.0),knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	hca_1.7.1.tar.gz
Windows二进制	hca_1.7.1.zip
macOS二进制(x86_64)	hca_1.7.1.tgz
macOS二进制(arm64)	hca_1.7.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hca
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ hca
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/hca/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hca/
包下载报告	下载数据