Gwascat
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doi：10.18129/b9.bioc.gwascat
这是发展Gwascat的版本；对于稳定版本，请参阅Gwascat。
在EMBL-EBI GWAS目录中代表和建模数据
生物导体版本：开发（3.16）
在EMBL-EBI GWAS目录中代表和建模数据。
作者：vj Carey
维护者：vj Carey
引用（从r内，输入引用（“ Gwascat”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ gwascat”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Gwascat”）
| html | R脚本 | GWASCAT- GRANGE for GWAS HITS中的EBI目录 |
| html | R脚本 | Gwascat：结构和查询NHGRI GWAS目录 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 遗传学，，，，软件 |
| 版本 | 2.29.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.10（R-2.15）（10。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.5.0），方法 |
| 进口 | S4VECTORS（> = 0.9.25），iranges，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机（> = 1.29.6），GenomicFeatures，，，，readr，，，，生物弦，，，，AnnotationDbi，，，，Biocfilecache，，，，snpstats，，，，变体，，，，AnnotationHub |
| 链接 | |
| 建议 | do.db，，，，DT，，，，尼特，，，，rbgl，，，，测试，，，，rmarkDown，，，，dplyr，，，，GVIZ，，，，rsamtools，，，，rtracklayer，，，，图形，，，，GGBIO，，，，延迟，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，org.hs.eg.db，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37 |
| URL | |
| 取决于我 | 举起，，，，vtpnet |
| 进口我 | Circrnaprofiler |
| 建议我 | GenomicsCores，，，，grasp2db，，，，hmdbquery，，，，ldblock，，，，parglms，，，，tfutils |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | gwascat_2.29.2.2.tar.gz |
| Windows二进制 | gwascat_2.29.2.2.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | gwascat_2.29.2.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/gwascat |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gwascat/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
