gtrellis

DOI:10.18129 / B9.bioc.gtrellis

这是发展格栅的版本;稳定版请参见gtrellis．

基因组级网格布局

Bioconductor版本:开发(3.17)

基因组水平格状图以基因组类别(例如染色体)为条件可视化基因组数据。对于每个基因组类别，以轨迹表示的多维数据从不同方面描述了不同的特征。该软件包提供了高度的灵活性来安排基因组类别，并在图中添加自定义的图形。

作者:顾祖光[aut, cre]

维护者:祖光谷

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("gtrellis")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“gtrellis”)

超文本标记语言	R脚本	制作基因组级别的格子图
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序，软件，可视化
版本	1.31.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(8年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R(>= 3.1.2)，网格，IRanges，GenomicRanges
进口	circlize(> = 0.4.8),GetoptLong， grDevices, utils
链接
建议	testthat(> = 1.0.0),knitr，RColorBrewer，减价，rmarkdown，ComplexHeatmap(> = 1.99.0),开罗，png，jpeg，tiff
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/gtrellis
全靠我
进口我	YAPSA
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	gtrellis_1.31.0.tar.gz
Windows二进制	gtrellis_1.31.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	gtrellis_1.31.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	gtrellis_1.31.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gtrellis
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gtrellis
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/gtrellis/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gtrellis/
软件包下载报告	下载数据