gtrellis

DOI:10.18129 / B9.bioc.gtrellis

这是发展格栅的版本;稳定版请参见gtrellis

基因组级网格布局

Bioconductor版本:开发(3.17)

基因组水平格状图以基因组类别(例如染色体)为条件可视化基因组数据。对于每个基因组类别,以轨迹表示的多维数据从不同方面描述了不同的特征。该软件包提供了高度的灵活性来安排基因组类别,并在图中添加自定义的图形。

作者:顾祖光[aut, cre]

维护者:祖光谷

引文(从R内,输入引用(“gtrellis”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("gtrellis")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“gtrellis”)

超文本标记语言 R脚本 制作基因组级别的格子图
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 测序软件可视化
版本 1.31.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(8年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于 R(>= 3.1.2),网格,IRangesGenomicRanges
进口 circlize(> = 0.4.8),GetoptLong, grDevices, utils
链接
建议 testthat(> = 1.0.0),knitrRColorBrewer减价rmarkdownComplexHeatmap(> = 1.99.0),开罗pngjpegtiff
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/jokergoo/gtrellis
全靠我
进口我 YAPSA
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 gtrellis_1.31.0.tar.gz
Windows二进制 gtrellis_1.31.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) gtrellis_1.31.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) gtrellis_1.31.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gtrellis
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/gtrellis
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/gtrellis/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/gtrellis/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网