gsean

DOI:10.18129 / B9.bioc.gsean

这是发展gsean版本;稳定的发布版本,请参阅gsean

基因集富集分析网络

Bioconductor版本:发展(3.18)

生物分子在生物很少单独工作。他们通常彼此合作的方式进行交互。生物过程太复杂,理解不考虑这样的交互。因此,基于网络的程序可以被视为强大的方法来研究复杂的过程。然而,许多分析方法设计了单个基因。据说基因技术基于生物网络如co-expression比那些使用更精确的方式来表示信息列表的基因。这个包的目的是将基因表达和生物网络。生物网络是由基因表达数据和用于基因集富集分析。

作者:Dongmin荣格

维护人员:Dongmin荣格< dmdmjung gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“gsean”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“gsean”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“gsean”)

HTML R脚本 gsean
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,GraphAndNetwork,网络,NetworkEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod
版本 1.21.2
Bioconductor自 BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.5),fgsea,PPInfer
进口
链接
建议 SummarizedExperiment,pasilla,org.Dm.eg.db,AnnotationDbi,情节knitr WGCNA rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 gsean_1.21.2.tar.gz
Windows二进制 gsean_1.21.2.zip
macOS二进制(x86_64) gsean_1.21.2.tgz
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gsean
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gsean
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/gsean/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/gsean/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网