这是发展Grohmm的版本;对于稳定版本,请参阅grohmm。
生物导体版本:开发(3.16)
用于分析GRO-SEQ数据的管道。
作者:Charles G. Danko,Minho Chae,Andre Martins,W。LeeKraus
维护者:utsouthwestern.edu>的Anusha Nagari
引用(从r内,输入引用(“ grohmm”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ grohmm”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Grohmm”)
R脚本 | Grohmm教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 测序,,,,软件 |
版本 | 1.31.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(8年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.5.0),大量的, 平行,S4VECTORS(> = 0.17.25),iranges(> = 2.13.12),GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.31.8),基因组签名(> = 1.15.6),rtracklayer(> = 1.39.7) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,GenomicFeatures,,,,EDGER,,,,org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/kraus-lab/grohmm |
BugReports | https://github.com/kraus-lab/grohmm/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | grohmm_1.31.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | grohmm_1.31.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/grohmm |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/grohmm |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/grohmm/ |
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