grohmm

doi:10.18129/b9.bioc.grohmm

这是发展Grohmm的版本;对于稳定版本,请参阅grohmm

GRO-SEQ分析管道

生物导体版本:开发(3.16)

用于分析GRO-SEQ数据的管道。

作者:Charles G. Danko,Minho Chae,Andre Martins,W。LeeKraus

维护者:utsouthwestern.edu>的Anusha Nagari ,tulip nandu

引用(从r内,输入引用(“ grohmm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ grohmm”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Grohmm”)

PDF R脚本 Grohmm教程
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 测序,,,,软件
版本 1.31.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(8年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.5.0),大量的, 平行,S4VECTORS(> = 0.17.25),iranges(> = 2.13.12),GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.31.8),基因组签名(> = 1.15.6),rtracklayer(> = 1.39.7)
进口
链接
建议 生物使用,,,,GenomicFeatures,,,,EDGER,,,,org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL https://github.com/kraus-lab/grohmm
BugReports https://github.com/kraus-lab/grohmm/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 grohmm_1.31.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉) grohmm_1.31.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/grohmm
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/grohmm
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/grohmm/
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  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网