GPART
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doi：10.18129/b9.bioc.gpart
这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。
这是发展GPART的版本；对于稳定版本，请参阅GPART。
通过识别单倍型块对密集测序数据的人类基因组分配
生物导体版本：开发（3.16）
我们提供了一种新的SNP序列分区方法，该方法不仅基于LD块结构，而且还基于基因位置信息来分区整个SNP序列。GPART的LD块构造是使用Big-LD算法进行的，与Kim等人（2017年）中报道的先前版本相比，它具有进一步的改进。我们还添加了一个可视化工具，以显示LD块边界和包装中基因位置的信息。
作者：Sun Ah Kim [AUT，CRE，CPH]，Yun Joo Yoo [AUT，CPH]
维护者：sun ah kim
引用（从r内，输入引用（“ Gpart”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ gpart”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 聚类，，，，软件 |
| 版本 | 1.15.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），网格，同性恋，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown |
| 进口 | Igraph，，，，Biomart，，，，RCPP，，，，Data.Table，，，，有机体，，，，AnnotationDbi，grdevices，统计，utils，基因组机，，，，iranges |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gpart |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/gpart |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gpart/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
